故事发生在1948年，当时特别调查局的一名关键成员俞北平（陈建斌饰演）被上级调到青城，调查那里发生的谋杀案。然而，在现实中，俞北平的真实身份正在被上级调查和怀疑，他总是处于危险之中。在青城，俞北平遇到了一个叫林莎的女人（齐neneneba锡饰演）。作为一名美军中尉，她的真实身份实际上是俞北平失散多年的女儿。于北平还有一个小女儿，名叫徐丹妮（朱颜漫子饰演）。此时，在青城上大学时，她与一位已婚的大学教授陷入了一段浪漫的关系，无法自拔。与此同时，由于俞北平的特殊身份，她与父亲的关系也陷入僵局。俞北平在对付狡猾阴险的敌人时，不得不成功地完成上级下达的任务。与此同时，他还不得不忍受来自近亲的困惑和误解，他陷入了一场苦战。

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【父亲的身份】吾身犯险以安人民

逻辑漏洞多到爆就不说了。最大的问题是对人物的刻画，完全是混乱的，一点都不真实。整体和《潜伏》差了几百个档次。
清城局的一票中层为什么对俞美女这么忠心耿耿？他们也看脸？任何正常的逻辑都应该是紧抱厅座女婿的大腿吧，别说这个还是名义上的主任。特别是俞美女都进了监狱失势了，而且到最后眼看要撤退了不想着转移财产什么的还对搞俞北平主这么上心？这是和俞北平有什么深仇大恨啊。我很怀疑以他们的智商怎么混上这个位置的。
从俞美女自己来说，她不像陆桥山、马奎这种是有后台的，她的后台只有徐文正，这么对抗徐文正算是个什么事，还和对手系统的人搞的不清不楚的，她心这么大？李涯就算一心为党国也知道做事应该对余不对站长吧。
还有徐文正，最后居然自杀了，前几天还在搞古玩恋家看起来是吴站长的路子，到最后又正义凛然起来了，斗争了那么久的老狐狸说背锅就背锅，还搞得像是主动背锅为党国献身？这定位到底是像吴站长还是像李涯啊。
整个剧的KMT人物设定都太假了，只有戏份少的程忠义从爱美人角度讲的过去

才开始看时，寄予厚望，前几集，甚至期待能达到《潜伏》的高度！但是，26集看下来越来越没有耐心！改低评分！
郑诩太过精彩出色，所以俞北平显得太弱，就像个被架空的傀儡！没有一点实权，也没有一个心腹之人，整天如丧家之犬时时事事被郑诩怀疑、猜疑。都这么多人怀疑俞北平的身份了，还能让他如此堂而皇之的在特调局呆着？！是国民党情报机关的高层都是傻子，还是当观众是傻的？！蒋介石和毛人凤对共党一向奉行的不都是“宁可错杀三千不可放过一个”么？！
剧情发展下来，BUG越来越多，节奏拖拉，看得心累！
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无意间调台看到《父亲的身份》，刚开始播第2集，首先映入眼帘是冯恩鹤老先生的脸，当时第一感觉是，啊！冯老又出来了！好久没看过他的戏了！他在《潜伏》中表现实在太深入人心、出神入化，导致看到他就会自动联想到吴站长。在《父亲的身份》中，他饰演南京国防部高官。[img=3:C][/img]
接着，俞北平和郑翊（陈建斌和俞飞鸿）两个高手对决

漏洞太多：14集为例：1:林莎进卫生间，北平直接拿包查看，就不怕她随时出来？2.她给北平下药喝酒后，去卫生间洗了杯子，放回桌子后并没有在里面加酒，正在纳闷为何不加酒，北平醒来后，却从杯里到出了一滴酒。3:谢楠接到电报：和（俞）断绝联系，为何不用代号？保密工作太差4：北平夜晚进入林莎家里搜查，为何开大灯？不怕外面看到？细节决定成败，不如《潜伏》和《悬崖》。

作为一个谍战片，如果第一集就被怀疑是共产党，居然还能派到那么重要的位置，我也是醉了。然后就是不顾顶头上司的想法，查人家女婿，关键是顶头上司还坚持真理，让人去查，确定是真的国民党嘛，不是给湾湾洗白的？瞒着领导勾结外面的情报机构，是情报组织大忌，基本上可以直接毙了，居然啥事都没有，还想当然的把相好的再派过去帮忙，确定是真的情报机构嘛。后来俞北平都被共产党差点打死了，居然还能怀疑说他是演戏，那一枪可是运气好，万一打死了怎么说。不是说不能让反派智商高，但是神化反派我真的看不懂

看到最后一集，编剧没落入俗套，徐丹妮活了下来，活到2015年，再怎么着，也可露露脸吧？就这样仓促结束了？俞北平一直没回来，按理说他活下来肯定要回来见女儿的，他是党的功臣，没有理由不回来。但是，到了2015年，他的小女儿都85岁了，他怕早就做古，只有一个推测，最后飞机被孙德利动了手脚，爆炸了，没能安全抵达香港。想到这里有太多遗憾。
PS:追了两个星期，终于追完了，我觉得有的人只看了几集就评论剧情怎么怎么的，都是对没看过想看的观众一个误导，我是觉得挺精彩的，除了中间几集有点拖沓